In vivo صفحه نمایش حذفی دوگانه CAR-T جفت های ژن ضد تومور هم افزایی را ترسیم می کند

سلول درمانی گیرنده آنتی ژن کایمریک (CAR)-T درمان بدخیمی های خونی را متحول کرده است، اما اثربخشی آن توسط مکانیسم های نظارتی منفی متعدد ذاتی سلول های T 1، 2، 3، 4 محدود می شود. در اینجا ما یک صفحه نمایش CRISPR با عملکرد بالا در داخل بدن CAR-T دو ناک اوت (DKO) انجام می دهیم و چندین جفت ژن DKO را شناسایی می کنیم که هم موثر و هم هم افزایی هستند. جفت بالایی، NR4A1 - SOCS3 DKO، دارای چندین ویژگی ایمونولوژیکی مطلوب است.

پروفایل کل رونویسی و توالی یابی RNA تک سلولی in vivo نشان می دهد که NR4A1 - SOCS3 DKO به طور خاص مسیرهای متابولیک را در سلول های CAR-T تنظیم می کند که آمادگی متابولیکی و فعالیت میتوکندریایی را به طور قابل توجهی نشان می دهد. سلول‌های NR4A1 - SOCS3 DKO CAR-T و سلول‌های T اثربخشی ضد توموری فوق‌العاده قوی و کنترل طولانی‌مدت تومور را در مدل‌های مختلف تومور بدون به خطر انداختن ویژگی‌های ایمنی از خود نشان می‌دهند. NR4A1 - SOCS3 DKO از چندین اصلاح تک ژنی و دو ژنی معیار در سلول های T و سلول های CAR-T 5، 6، 7، 8، 9 بهتر عمل می کند.

این داده‌ها غربالگری CAR-T DKO در داخل بدن را برای کشف سریع اهداف ترکیبی نشان می‌دهند و NR4A1 - SOCS3 را به عنوان یک جفت ایستگاه بازرسی درون سلولی امیدوارکننده برای مهندسی درمان‌های CAR-T با کارایی بالا علیه سرطان ایجاد می‌کنند.

این یک پیش نمایش از محتوای اشتراک است که از طریق موسسه شما دسترسی دارد

به Nature و 54 مجله Nature Portfolio دیگر دسترسی داشته باشید

Nature+ را دریافت کنید، بهترین اشتراک دسترسی آنلاین ما

قیمت‌ها ممکن است مشمول مالیات‌های محلی باشد که در هنگام تسویه حساب محاسبه می‌شود

تمام داده های تولید شده یا تجزیه و تحلیل شده در این مطالعه در این مقاله، اطلاعات تکمیلی آن، فایل های داده منبع و مجموعه داده های تکمیلی گنجانده شده است یا از طریق مخازن عمومی در دسترس است. داده‌های توالی‌یابی با توان پردازشی بالا و خام تولید شده در این مطالعه، از جمله توالی‌یابی صفحه نمایش CRISPR، توالی‌یابی آمپلیکون هدفمند، داده‌های توالی RNA-seq، RNA-seq تک سلولی، CUT&RUN و داده‌های WGS، در گذرگاه ژنی بیان ژن تحت شماره‌های دستیابی GSE215735، و GSE25735، و GSE215737 Seq و GSE25733 ذخیره شده‌اند. بایگانی با شماره دسترسی PRJNA1477126.

داده‌های منبع و اطلاعات آماری برای آزمایش‌های بدون توان عملیاتی، از جمله فلوسیتومتری، آنالیز پروتئین، آنالیزهای تصویربرداری و سایر سنجش‌های مولکولی یا سلولی، همراه با این مقاله به عنوان فایل‌های داده منبع ارائه شده‌اند. نتایج پردازش شده و کمیت‌های مربوطه از آزمایش‌های با توان بالا در مجموعه داده‌های تکمیلی ارائه شده‌اند.

مجموعه داده‌ها و منابع مرجع در دسترس عمومی زیر در این مطالعه استفاده شد: ژنوم مرجع انسانی GRCh38 Gencode v44 برای تجزیه و تحلیل‌های RNA-seq انبوه. ژنوم مرجع انسانی GRCh38 Gencode v37 برای تجزیه و تحلیل RNA-seq تک سلولی. ژنوم مرجع انسان GRCh38 Gencode v47 و ENCODE مناطق لیست سیاه برای GRCh38 برای تجزیه و تحلیل WGS. پایگاه داده امضاهای مولکولی (MSigDB v7.4)؛ و مجموعه داده اطلس سلول T تک سلولی ProjectTILs. رده های سلولی والدین از منابع تجاری فهرست شده در روش ها و اطلاعات تکمیلی در دسترس هستند.

خطوط سلولی مهندسی شده، پلاسمیدها و سایر مواد تحقیقاتی تولید شده در این مطالعه در صورت درخواست معقول و تکمیل هر گونه قرارداد انتقال مواد مورد نیاز، از نویسنده مسئول در دسترس است. داده های منبع با این مقاله ارائه شده است.

کد سفارشی مورد استفاده برای تجزیه و تحلیل داده ها و تولید شکل در این مطالعه در GitHub (https://github.com/Prenauer/DKO-CAR-T) موجود است.

Li, Y.-R., Zhu, Y., Halladay, T. & Yang, L. In vivo مهندسی خودرو برای ایمونوتراپی. نات کشیش ایمونول. 25، 725-744 (2025).

Zebley, C. C. & Youngblood, B. مکانیسم های فرسودگی سلول T که ایمونوتراپی نسل بعدی را هدایت می کند. روند سرطان 8، 726-734 (2022).

Kirchhammer، N.، Trefny، M. P.، Auf der Maur، P.، Läubli، H. & Zippelius، A. ایمونوتراپی های ترکیبی سرطان: استراتژی های درمانی نوظهور سازگار با ریزمحیط تومور. علمی ترجمه پزشکی 14, eabo3605 (2022).

پاتل، یو و همکاران درمان با سلول T CAR در تومورهای جامد: مروری بر آزمایش‌های بالینی فعلی eJHaem 3، 24-31 (2022).

وی، جی و همکاران هدف قرار دادن REGNASE-1 سلول های T موثر با عمر طولانی را برای درمان سرطان برنامه ریزی می کند. Nature 576, 471–476 (2019).

Carnevale, J. et al. فرسایش RASA2 در سلول های T حساسیت آنتی ژن و عملکرد طولانی مدت را افزایش می دهد. Nature 609، 174-182 (2022).

فریتاس، K. A. و همکاران. افزایش فعالیت موثر سلول T با هدف قرار دادن مدول کیناز Mediator. Science 378, eabn5647 (2022).

Arce، M. M. و همکاران. کنترل مرکزی مدارهای ژنی پویا بر استراحت و فعال شدن سلول های T حاکم است. Nature 637، 930-939 (2025).

آگاروال، اس و همکاران. حذف گیرنده مهاری CTLA-4 سلول های T گیرنده آنتی ژن کایمریک را تقویت و تقویت می کند. مصونیت 56، 2388-2407.e9 (2023).

Rowshanravan, B., Halliday, N. & Sansom, D. M. CTLA-4: یک هدف متحرک در ایمونوتراپی. Blood 131, 58-67 (2018).

Sharpe، A. H. & Pauken، K. E. عملکردهای متنوع مسیر مهاری PD1. نات کشیش ایمونول. 18، 153-167 (2018).

Sitaram، P.، Uyemura، B.، Malarkannan، S. & Riese، M. J. فراتر از سطح سلول: هدف قرار دادن تنظیم کننده های منفی درون سلولی برای افزایش فعالیت ضد تومور سلول T. بین المللی جی. مول. علمی 20, 5821 (2019).

لیو، ایکس و همکاران. تجزیه و تحلیل گسترده ژنوم NR4A1 را به عنوان یک واسطه کلیدی اختلال عملکرد سلول T شناسایی می کند. Nature 567, 525–529 (2019).

چن، جی و همکاران. فاکتورهای رونویسی NR4A عملکرد سلول های CAR T را در تومورهای جامد محدود می کنند. Nature 567, 530–534 (2019).

سئو، اچ و همکاران. فاکتورهای رونویسی TOX و TOX2 با فاکتورهای رونویسی NR4A برای تحمیل فرسودگی سلول های CD8 + T همکاری می کنند. Proc. Natl Acad. علمی USA 116, 12410–12415 (2019).

هنریکسون، جی و همکاران. صفحه نمایش CRISPR در سطح ژنوم در سلول های کمکی T، تداخل فراگیر بین فعال سازی و تمایز را نشان می دهد. Cell 176, 882–896.e18 (2019).

Shifrut، E. و همکاران. صفحه نمایش CRISPR در سطح ژنوم در سلول های T اولیه انسان، تنظیم کننده های کلیدی عملکرد ایمنی را نشان می دهد. Cell 175, 1958–1971.e15 (2018).

Shi, H., Doench, J. G. & Chi, H. CRISPR غربالگری برای بازجویی عملکردی ایمنی. نات کشیش ایمونول. 23، 363-380 (2023).

Zhou, L., Yang, L., Feng, Y. & Chen, S. غربالگری جمعی با ابزارهای ویرایش ژن نسل بعدی. Curr. نظر. بیومد. مهندس 28, 100479 (2023).

Zhou، X.، Renauer، P. A.، Zhou، L.، Fang، S.-Y. & Chen, S. کاربردهای فناوری CRISPR در ایمونوتراپی سلولی. ایمونول. Rev. 320, 199-216 (2023).

دونگ، ام بی و همکاران. کشف هدف ایمونوتراپی سیستماتیک با استفاده از نمایشگرهای CRISPR در داخل بدن در مقیاس ژنوم در سلول‌های CD8 T. سلول 178، 1189-1204.e23 (2019).

Ye, L. et al. غربالگری in vivo CRISPR در سلول‌های CD8 T با وکتورهای هیبریدی AAV-Sleeping Beauty، اهداف غشایی را برای بهبود ایمونوتراپی برای گلیوبلاستوما شناسایی می‌کند. نات بیوتکنول. 37، 1302–1313 (2019).

دای، ایکس و همکاران. مهندسی موازی موازی سلول های T انسانی. نات بیوتکنول. 41، 1239-1255 (2023).

چن، ز و همکاران. غربالگری CRISPR سلول های CD8 + T در داخل بدن، کنترل Fli1 را در عفونت و سرطان نشان می دهد. Cell 184, 1262-1280.e22 (2021).

هوانگ، اچ و همکاران. غربالگری CRISPR در داخل بدن، فرآیندهای سیگنالینگ مواد مغذی را نشان می دهد که تصمیمات سرنوشت سلول های CD8 + T را تشکیل می دهند. Cell 184, 1245-1261.e21 (2021).

فو، جی و همکاران. کنترل متابولیک سلول های TFH و ایمنی هومورال توسط فسفاتیدیل اتانول آمین Nature 595، 724-729 (2021).

Guo, A. et al. اجزای کمپلکس cBAF و MYC در اوایل سرنوشت سلول های CD8 + T همکاری می کنند. Nature 607، 135-141 (2022).

شن، جی پی و همکاران. صفحه نمایش ترکیبی CRISPR-Cas9 برای نقشه برداری جدید از تعاملات ژنتیکی. نات Methods 14, 573-576 (2017).

چاو، R. D. و همکاران. پروفایل in vivo ناک اوت های دوگانه متاستاتیک از طریق صفحه نمایش CRISPR-Cpf1. نات روش 16، 405-408 (2019).

Campa، C. C.، Weisbach، N. R.، Santinha، A. J.، Incarnato، D. & Platt، R. J. مهندسی ژنوم چندپلکس شده توسط آرایه‌های Cas12a و CRISPR که روی رونوشت‌های منفرد کدگذاری شده‌اند. نات روش 16، 887-893 (2019).

لی، آر و همکاران بهینه سازی مقایسه ای صفحه نمایش های ترکیبی CRISPR. نات اشتراک. 13, 2469 (2022).

تانگ، اس و همکاران. تولید کتابخانه gRNA دوگانه برای غربالگری ترکیبی CRISPR جفت‌های ژن کشنده مصنوعی. STAR Protoc. 3, 101556 (2022).

پرینزینگ، بی و همکاران. حذف DNMT3A در سلول های CAR T از خستگی جلوگیری می کند و فعالیت ضد توموری را افزایش می دهد. علمی ترجمه پزشکی 13, eabh0272 (2021).

لافلور، ام. دبلیو و همکاران PTPN2 تولید زیرجمعیت های سلول های CD8 + T خسته را تنظیم می کند و ایمنی تومور را مهار می کند. نات ایمونول. 20, 1335–1347 (2019).

آکی، دی و همکاران. لیگازهای E3 Itch و WWP2 برای محدود کردن تمایز TH2 با افزایش سیگنال دهی از طریق TCR همکاری می کنند. نات ایمونول. 19، 766-775 (2018).

نوریوا، R. I. و همکاران. E3 یوبیکوئیتین لیگاز GRAIL تحمل سلول های T و عملکرد سلول های T تنظیمی را با واسطه در تخریب گیرنده سلول T-CD3 تنظیم می کند. مصونیت 32، 670-680 (2010).

هوانگ، سی.-ای. و همکاران کمبود DUSP4 بیان CD25 و تکثیر سلول های CD4 + T را بدون ایجاد مانع در رشد سلول های T افزایش می دهد. یورو J. Immunol. 42، 476-488 (2012).

داشفسکی، او و همکاران. استفاده از ژن های گیرنده بویایی به عنوان کنترل برای مطالعات ژنومی عملکردی CRISPR در مقیاس ژنوم برای تعریف مکانیسم های مقاومت در برابر درمان. Blood 136, 36 (2020).

ژائو، دی و همکاران. صفحات متابولیک ترکیبی CRISPR-Cas9 نقاط کنترل ردوکس بحرانی وابسته به محور تنظیمی KEAP1-NRF2 را نشان می دهد. مول. Cell 69, 699–708.e7 (2018).

یانگ، ال و همکاران مهندسی OR7A10 GPCR درمان CAR-NK را در برابر تومورهای جامد تقویت می کند. Nature 652، 740-751 (2026).

Rosskopf, S. et al. یک سیستم گزارشگر پارامتر سه گانه مبتنی بر Jurkat 76 برای ارزیابی عملکردهای TCR و استراتژی های سلول T پذیرفته شده. Oncotarget 9، 17608–17619 (2018).

Ye, L. et al. یک صفحه نمایش CRISPR با افزایش عملکرد در مقیاس ژنوم در سلول های CD8 T متابولیسم پرولین را به عنوان وسیله ای برای تقویت درمان CAR-T شناسایی می کند. سلول متاب. 34، 595-614.e14 (2022).

Mise-Omata، S. et al. حذف SOCS3 در سلول‌های T موثر، نقش ضد توموری IL-6 را به سیتوکین پروتومورزا می‌دهد. Cell Rep. 42, 112940 (2023).

نگیشی، اس و همکاران. استراتژی های درمانی برای عود پس از درمان با سلول های T CAR در لنفوم سلول B. جلو. اطفال 11, 1305657 (2023).

لیبرزون، A. و همکاران. مجموعه ژن مشخصه پایگاه داده امضاهای مولکولی (MSigDB). سیستم سلولی 1، 417-425 (2015).

Shi, H., Chen, S. & Chi, H. ایمونومتابولیسم تمایز سلول CD8 + T در سرطان. روند سرطان 10، 610-626 (2024).

دوموتیوز، ن. و همکاران. بیان اجباری PGC-1α تناسب سلول های CD8 T، تشکیل حافظه و ایمنی ضد تومور را ارتقا می دهد. سلول مول. ایمونول. 18، 1761-1771 (2021).

آندراتا، ام و همکاران. تفسیر حالات سلول T از داده‌های رونویسی تک سلولی با استفاده از اطلس مرجع. نات اشتراک. 12, 2965 (2021).

لیو، ی و همکاران گیرنده های کایمریک STAR با استفاده از ماشین آلات TCR واکنش های قوی در برابر تومورهای جامد را واسطه می کنند. علمی ترجمه پزشکی 13, eabb5191 (2021).

Nelson، R. FDA در حال بررسی خطرات ایمنی در گیرندگان CAR T-cell. Lancet 402، 2181 (2023).

اشبرنر، ام. و همکاران. هستی شناسی ژن: ابزاری برای وحدت زیست شناسی نات ژنت 25، 25-29 (2000).

کنسرسیوم هستی شناسی ژن. پایگاه دانش هستی شناسی ژن در سال 2023. ژنتیک 224، iyad031 (2023).

اشمیدل، بی جی و همکاران. تاثیر پلی‌مورفیسم‌های ژنتیکی بر بیان ژن سلول‌های ایمنی انسان Cell 175, 1701–1715.e16 (2018).

جونگ، جی و همکاران غربالگری فعال سازی رونویسی و حذفی CRISPR-Cas9 در مقیاس ژنوم. نات پروتکل 12، 828-863 (2017).

Martin, M. Cutadapt دنباله‌های آداپتور را از خواندن توالی با توان بالا حذف می‌کند. EMBnet.journal https://doi.org/10.14806/ej.17.1.200 (2011).

Langmead, B., Trapnell, C., Pop, M. & Salzberg, S. L. همراستایی فوق سریع و حافظه کارآمد توالی های DNA کوتاه با ژنوم انسان. ژنوم بیول. 10، R25 (2009).

Li، X.، Cooper، N. G. F.، O'Toole، T. E. & Rouchka، E. C. انتخاب نرمال‌سازی اندازه کتابخانه و روش‌های آماری برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل در مقایسه‌های متعادل دو گروهی برای مطالعات RNA-seq. BMC Genomics 21, 75 (2020).

Lun, A. T. L., Chen, Y. & Smyth, G. K. It’s DE-licious: دستوری برای تجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل آزمایش‌های RNA-seq با استفاده از روش‌های شبه درستنمایی در edgeR. روش ها مول. Biol. 1418، 391-416 (2016).

ریچی، ام. ای. و همکاران. تجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل قدرت لیما برای توالی یابی RNA و مطالعات ریزآرایه. Nucleic Acids Res. 43، e47 (2015).

کلمنت، ک. و همکاران. CRISPResso2 تجزیه و تحلیل دقیق و سریع توالی ژنوم را ارائه می دهد. نات بیوتکنول. 37، 224-226 (2019).

Roederer, M., Nozzi, J. L. & Nason, M. C. SPICE: کاوش و تجزیه و تحلیل مجموعه داده‌های چند متغیره پیچیده پس از سیتومتری. سیتومتری A 79، 167-174 (2011).

Bray, N. L., Pimentel, H., Melsted, P. & Pachter, L. کمیت RNA احتمالی تقریبا بهینه. نات بیوتکنول. 34، 525-527 (2016).

فرانکیش، آ و همکاران. Gencode 2021. Nucleic Acids Res. 49، D916–D923 (2021).

هائو، ی و همکاران یادگیری فرهنگ لغت برای تجزیه و تحلیل تک سلولی یکپارچه، چندوجهی و مقیاس پذیر. نات بیوتکنول. https://doi.org/10.1038/s41587-023-01767-y (2023).

ولش، جی دی و همکاران. ادغام چند omic تک سلولی ویژگی های هویت سلول مغز را مقایسه و تضاد می کند. Cell 177, 1873–1887.e17 (2019).

تراپنل، سی و همکاران. پویایی و تنظیم کننده تصمیمات سرنوشت سلولی با ترتیب شبه زمانی سلول های منفرد آشکار می شود. نات بیوتکنول. 32، 381-386 (2014).

ایبار، اس و همکاران. SCENIC: استنتاج و خوشه بندی شبکه تنظیمی تک سلولی. نات روش 14، 1083-1086 (2017).

اندروز، S. FastQC: یک ابزار کنترل کیفیت برای داده های توالی توان عملیاتی بالا. GitHub https://github.com/s-andrews/FastQC (2010).

Langmead, B. & Salzberg, S. L. تراز خواندن سریع با شکاف با Bowtie 2. Nat. Methods 9, 357-359 (2012).

Danecek، P. et al. دوازده سال SAMtools و BCFtools. Gigascience 10، giab008 (2021).

Quinlan, A. R. & Hall, I. M. BEDTools: مجموعه ای انعطاف پذیر از ابزارهای کاربردی برای مقایسه ویژگی های ژنومی. بیوانفورماتیک 26، 841-842 (2010).

Amemiya، H. M.، Kundaje، A. & Boyle، A. P. فهرست سیاه ENCODE: شناسایی مناطق مشکل ساز ژنوم. علمی Rep. 9, 9354 (2019).

Zhang، Y. و همکاران. تجزیه و تحلیل مبتنی بر مدل از Chip-seq (MACS). ژنوم بیول. 9، R137 (2008).

هاینز، اس و همکاران. ترکیب ساده فاکتورهای رونویسی تعیین‌کننده اصل و نسب، عناصر تنظیم‌کننده سیس مورد نیاز برای ماکروفاژها و هویت‌های سلول B است. مول. سلول 38، 576-589 (2010).

رامیرز، اف و همکاران. deepTools2: یک وب سرور نسل بعدی برای تجزیه و تحلیل داده های توالی یابی عمیق. Nucleic Acids Res. 44، W160–W165 (2016).

Li, H. & Durbin, R. تراز خواندن کوتاه سریع و دقیق با تبدیل Burrows-Wheeler. بیوانفورماتیک 25، 1754-1760 (2009).

مک کنا، A. و همکاران. جعبه ابزار تجزیه و تحلیل ژنوم: چارچوب MapReduce برای تجزیه و تحلیل داده های توالی یابی DNA نسل بعدی. ژنوم Res. 20، 1297-1303 (2010).

کامرون، دی ال و همکاران GRIDSS: تشخیص بازآرایی ژنومی حساس و خاص با استفاده از مونتاژ گراف موقعیتی de Bruijn. ژنوم Res. 27، 2050–2060 (2017).

Zhang, H., Meltzer, P. & Davis, S. RCircos: یک بسته R برای نمودارهای مسیر دوبعدی Circos. BMC Bioinformatics 14، 244 (2013).

ما از A. Abiri و سایر اعضای آزمایشگاه برای به اشتراک گذاری معرف و/یا کمک تشکر می کنیم. R. A. Flavell، D. Schatz، C. Lucas و J. Craft برای نظرات علمی. P. Steinberger و K. Anderson برای به اشتراک گذاشتن خطوط سلولی خبرنگار Jurkat. آزمایشگاه شن برای کمک آزمایش اسب دریایی. و همه اعضای آزمایشگاه چن و امکانات اصلی مختلف برای پشتیبانی فنی.

S.C توسط موسسه تحقیقات سرطان Lloyd J. Old STAR Award و KCA CLIP Award (CRI4964 and CRI13945)، اتحاد برای درمان ژن سرطان (ACGT) و بنیاد خانواده Cinelli، NIH/NCI (R33CA281702 (R33CA281702) و DoD (R33CA281702) و DoD (R33CA281702) و DoD2125H HT9425-23-1-0860)، اتحاد تحقیقات سرطان Pershing Square Sohn، بنیاد سرطان پروستات، بیل اسپری و جایزه علمی تیم YCC. M.M. توسط HHMI-55108547، NIH/NCI R35CA197628، R01CA282877 و R01CA157644، و NIH/NIAID R01AI164692 و R01AI192914 پشتیبانی می شود. L.Z.

توسط Gruber Science Fellowship و Lo Fellowship of Excellence of Stem Cell Research پشتیبانی می شود. P.A.R. توسط کمک هزینه تحصیلی دکتری ییل از NIH (T32GM007499)، انجمن علمی عالی تحقیقات سلول های بنیادی Lo و برنامه بورسیه YCC T32 پشتیبانی می شود. K.T. توسط انجمن علمی گروبر پشتیبانی می شود. سی دی توسط بورسیه علوم داده های زیست پزشکی Boehringer Ingelheim پشتیبانی می شود. X.Z. توسط NIH/NCI K99/R00 Pathway to Independence Awards (K99CA282989 and R00CA282989) و بنیاد تحقیقات مارگارت کیو لندنبرگر پشتیبانی می شود.

این نویسندگان به طور مساوی مشارکت داشتند: لیکون ژو، پل آ. رناوئر، کایوان تانگ

گروه ژنتیک، دانشکده پزشکی دانشگاه ییل، نیوهیون، CT، ایالات متحده آمریکا

لیکون ژو (周立群)، پل آ. رناوئر، کای‌وان تانگ، شانشان لی، ژیچنگ لو، یانژی فنگ، شاون اچ. لین، فیفی ژانگ، دانیل پارک، شائو یو فانگ، گریس جلیقه، ژیهان ژائو، ویلیام دورست، چوان‌ویو یانگ ژیو، لوژیو یانگ ژونگ سیدی چن

موسسه زیست شناسی سیستم ها، دانشگاه ییل، وست هاون، سی تی، ایالات متحده آمریکا

گروه ایمونوبیولوژی، دانشگاه ییل، نیوهیون، CT، ایالات متحده آمریکا

لیکون ژو (周立群)، یانژی فنگ، شاون اچ لین، ژیهان ژائو و مارکوس موشن

برنامه ایمونوبیولوژی، دانشگاه ییل، نیوهیون، سی تی، ایالات متحده آمریکا

لیکون ژو (周立群)، یانژی فنگ، شاون اچ لین، ژیهان ژائو، مارکوس موشن و سیدی چن

برنامه زیست شناسی سلولی مولکولی، ژنتیک و توسعه، دانشگاه ییل، نیوهیون، CT، ایالات متحده آمریکا

مرکز انکولوژی مولکولی و سلولی، دانشگاه ییل، نیوهیون، CT، ایالات متحده آمریکا

گروه جراحی مغز و اعصاب، کالج پزشکی بیلور، تمپل، TX، ایالات متحده آمریکا

مرکز جامع سرطان دان ال دانکن و موسسه تحقیقات بالینی و ترجمه دان ال دانکن، کالج پزشکی بیلور، هیوستون، تگزاس، ایالات متحده آمریکا

برنامه علوم زیستی کمی و محاسباتی، کالج پزشکی بیلور، هیوستون، تگزاس، ایالات متحده آمریکا

مرکز واکسن و ایمونوتراپی، موسسه Wistar، فیلادلفیا، PA، ایالات متحده آمریکا

مرکز سرطان الن و رونالد کاپلان، موسسه ویستار، فیلادلفیا، PA، ایالات متحده آمریکا

گروه آسیب شناسی و پزشکی آزمایشگاهی، دانشگاه پنسیلوانیا، فیلادلفیا، PA، ایالات متحده آمریکا

مرکز جامع سرطان ییل، دانشکده پزشکی دانشگاه ییل، نیوهیون، سی تی، ایالات متحده آمریکا

مرکز سلول های بنیادی ییل، دانشکده پزشکی دانشگاه ییل، نیوهون، سی تی، ایالات متحده آمریکا

گروه انفورماتیک زیست پزشکی و علوم داده، دانشکده پزشکی دانشگاه ییل، نیوهیون، CT، ایالات متحده آمریکا

گروه جراحی مغز و اعصاب، دانشکده پزشکی دانشگاه ییل، نیوهیون، CT، ایالات متحده آمریکا

L.Z. و S.C. مطالعه را تصور کردند. L.Z.، P.A.R. و X.Z. صفحه نمایش ها را طراحی کرد L.Z. نمایشگرها را اجرا کرد. L.Z. و K.T. بیشتر آزمایش ها را با کمک نویسندگان مختلف انجام داد. P.A.R. آنالیزهای صفحه نمایش، RNA-seq و تک سلولی را انجام داد. K.T. آنالیزهای Amplicon-seq، CUT&RUN و WGS هدفمند را انجام دادند. S.L.، Z.L.، Y.F.، S.H.L.، F.Z.، D.P.، S.-Y.F.، G.V.، Z.Z.، W.D.، L.Y.، C.D.، X.P.، S.S.Y.، N.S. و L.P با آزمایش ها و تجزیه و تحلیل های مختلف کمک کردند. ی.ف.، ل.ک. و م.م. معرف ها و نمونه ها ارائه شده است. L.Z.، P.A.R.، K.T.، X.Z. و S.C.

نسخه خطی را با نظرات همه نویسندگان نوشته است. S.C تأمین مالی و نظارت کلی بر پروژه را انجام داد.

S.C یکی از بنیانگذاران EvolveImmune، Cellinfinity، MagicTime و Chen Consulting است. یک درخواست ثبت اختراع توسط دانشگاه ییل ثبت شده است. سایر نویسندگان هیچ منافع رقیبی را اعلام نمی کنند.

طبیعت از جوزف فرایتا، دالیا حیدر و داور(های) ناشناس دیگر برای مشارکتشان در بررسی همتایان این اثر تشکر می کند. گزارش های بازبین همتا در دسترس است.

یادداشت ناشر Springer Nature با توجه به ادعاهای قضایی در نقشه های منتشر شده و وابستگی های سازمانی بی طرف باقی می ماند.