هنگامی که DNA میکروبی کمیاب است، روش جدید پروفایل به جدا کردن سیگنال های واقعی از آلودگی کمک می کند.
در عفونتهای حاد و تهدیدکننده حیات، شناسایی سریع میکروارگانیسمهای موجود در نمونه بیمار میتواند به تشخیص و درمان کمک کند. روشهای محاسباتی که به عنوان پروفایلکنندههای طبقهبندی شناخته میشوند، میتوانند دادههای توالییابی متاژنوم تولید شده از اطلاعات ژنومی میکروارگانیسمها را تجزیه و تحلیل کنند و آن را با ژنومهای مرجع میکروارگانیسمهای منفرد مقایسه کنند. با این حال، پروفایل های طبقه بندی هنوز در حال توسعه هستند و…
در عفونتهای حاد و تهدیدکننده حیات، شناسایی سریع میکروارگانیسمهای موجود در نمونه بیمار میتواند به تشخیص و درمان کمک کند. روشهای محاسباتی که به عنوان پروفایلکنندههای طبقهبندی شناخته میشوند، میتوانند دادههای توالییابی متاژنوم تولید شده از اطلاعات ژنومی میکروارگانیسمها را تجزیه و تحلیل کنند و آن را با ژنومهای مرجع میکروارگانیسمهای منفرد مقایسه کنند. با این حال، پروفایلکنندههای طبقهبندی هنوز در حال توسعه هستند و هنوز مورد استفاده متداول نیستند. روش های فعلی می توانند نتایج مثبت کاذب یا تخمین فراوانی نادرست ایجاد کنند.
متن اصلی (انگلیسی)
When microbial DNA is scarce, new profiling method helps separate genuine signals from contamination
In acute, life-threatening infections, rapidly characterizing the microorganisms in a patient sample can help guide diagnosis and treatment. Computational methods known as taxonomic profilers can analyze metagenome sequencing data generated from the microorganisms' genomic information and compare it with reference genomes of individual microorganisms. However, taxonomic profilers are still under development and are…